Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED17Q9NVC6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms