Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDHAF3Q9NRP4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms