Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms