Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms