Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms