Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms