Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms