Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms