Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms