Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms