Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms