Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNMDQ9H2S6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNMDQ9H2S6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNMDQ9H2S6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNMDQ9H2S6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms