Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB1BQ9H0U4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms