Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms