Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms