Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUF2Q9BZD4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms