Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSD3Q9BZ95 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSD3Q9BZ95 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms