Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5DQ9BY66 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5DQ9BY66 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms