Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms