Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms