Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms