Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms