Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms