Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms