Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FYCO1Q9BQS8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FYCO1Q9BQS8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms