Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms