Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms