Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUFY1Q96T51 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms