Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN4Q96Q06 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN4Q96Q06 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms