Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms