Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS50Q96JG6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms