Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms