Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms