Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EAF2Q96CJ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EAF2Q96CJ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms