Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms