Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms