Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL5Q93034 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms