Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRAT1Q92837 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms