Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms