Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA2Q8TDQ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GNPDA2Q8TDQ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms