Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHDC9Q8NEP7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms