Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms