Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms