Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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