Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms