Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A9Q8IVB4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms