Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMB4Q86W47 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms