Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L3Q7Z443 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L3Q7Z443 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms