Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms