Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms